Pflanzen fixierten atmosphärischen Kohlenstoff in ihren oberirdischen Teilen durch Photosynthese und transportieren produzierte Assimilate von aktiven Bereichen (C Quellen) durch ihr Gefäßsystem zu photsynthetisch inaktiven Pflanzenorganen wie Wurzeln und Früchten mit Kohlenstoffbedarf (C-Senken). Neben dem Kohlenstoffbedarf der Pflanze für Wachstum und ihren Metabolismus stellt pflanzenbürtiger Kohlenstoff die primäre Kohlenstoffquelle für Bodenmikroorganismen da. Diese Dissertation untersucht wie Interaktionen zwischen Pflanzen und Bodenmikroorganismen die Verteilung von Kohlenstoff innerhalb der pflanze beeinflussen. Im ersten Experiment (Kapitel 2) wurde ein steriles „Split-Root“ System für 11C Messungen mit Gerste (Hordeum vulgare) als Modelpflanze etabliert. Experimente mit gfp und DSred markierten Pseudomonas fluorescent Stämmen zeigten, dass sich im etablierte „Split-Root“ System die Präsenz von inokulierte Mikroorganismen über die gesamte Dauer eines Experimentes auf den inokulierten Bereich beschränkte. Pulsmarkierungen von Blättern mit 11CO2 demonstrierten, dass mit diesem System die Translokation von Kohlenstoff in die Wurzeln in vivo gemessen werden konnte. Die Pflanzen investierten 50 % des aus den Blättern mobilisierten Kohlenstoff in ihr Wurzelsystem. 150 min nach der Markierung war 2-4% des in die Wurzeln exportierten Kohlenstoffes von den Wurzeln veratmet. Wasserlösliche Kohlenhydrate wurden detektiert werden, allerdings war die festgestellte Menge für eine Quantifizierung zu gering. Im zweiten Experiment (Kapitel 3) wurde im „Split-Root“ Ansatz der Einfluss von extern applizierter Jasmonsäure (JS) auf die Allokation von kurzfristig fixiertem Kohlenstoff untersucht. JS Behandlung einer Wurzelhälfte führte zu einer lokalen Hemmung des Wurzelwachstums und reduzierte (innerhalb von Minuten) den Kohlenstoff Transport in diese Hälfte, wohingegen die unbehandelte Wurzelhälfte einen verzögerten Anstieg des Kohlenstoffimportes zeigte. Im Gegensatz dazu führte ein durch Kühlung reduzierter Kohlenstoffbedarfs einer Wurzelhälfte nicht zu einem erhöhten Kohlenstofftransportes in die andere Wurzelhälfte. Die unterschiedlichen Effekte von JS und Kühlung lässt einen durch JS spezifische ausgelöste Signaltransduktion von der Wurzeln in den Spross vermuten welche folgend zu einer erhöhte Allokation von Kohlenstoff der nicht wachstumsinhibierten Wurzeln führt. In dritten Experiment (Kapitel 4) wurde der Einfluss des Wurzelpathogens Fusarium graminearum auf die Kohlenstoffallokation in Richtung und innerhalb des Wurzelsystems von Gerste untersucht. Es wurde die Hypothese überprüft, dass die Vorinokulation mit dem pflanzenwachstumsförderden Bodenbakterium Pseudomonas fluorescens CHA0 den Effekt vom Pathogenes abschwächen kann. Um zu testen ob die Fähigkeit Sekundärmetabolite zu produzieren involviert ist, wurde ein Stamm (P. fluorescens CHA19) genutzt, welcher nicht in der Lage ist Sekundärmetabolite zu produzieren. Behandlung von Gerstenwurzeln mit F. graminearum führte zu einer Reduzierung des Kohlenstofftransportes in die infizierte Wurzelhälfte und zu einem Anstieg der Allokation in die unbehandelte. Lokale oder systemische Vorinokulation der Wurzelhälften mit dem Wildtyp P. fluorescens führte zu einer Reduktion des F. graminearum-Effektes auf die Kohlenstoffallokation, wohin gegen die Mutante CHA19 nicht in der Lage war den Effekt von dem Pathogen abzumildern. Die Ergebnisse legen Nahe, dass die Produktion von Sekundärmetaboliten durch P. fluorescens zu einer systemische Resistenz gegen F. graminearum in Gerste führt. Zusammenfassend zeigen die Ergebnisse, dass Pflanzen in der Lage sind die Präsenz von spezifischen Bodenmikroorganismen zu detektieren, um mir einer direkten Änderung ihres Kohlenstofftransportes die Allokation und Investition von Kohlenstoff zu optimieren.