| Item Type: |
Ph.D. Thesis |
| Type of entry: |
Primary publication |
| Title: |
NMR-Spektroskopische Strukturaufklärung eines neuen antituberkulotisch wirksamen Depsipeptids und weiterer kleiner Moleküle |
| Language: |
German |
| Referees: |
Thiele, Prof. Dr. Christina M. ; Reggelin, Prof. Dr. Michael |
| Date: |
12 May 2016 |
| Place of Publication: |
Darmstadt |
| Date of oral examination: |
25 April 2016 |
| Abstract: |
Das Griselimycin-Derivat Methylgriselimycin (MGM) zeigt sowohl in vitro als auch in vivo hohe Aktivität gegen M. tuberculosis und ist somit ein vielversprechender Wirkstoffkandidat. Um einen tieferen Einblick in die Struktur-Aktivitäts-Beziehung zu erhalten und die Anwendbarkeit der RDC-Methode von kleinen Molekülen auf kleine und mittlere Peptide zu erforschen, wurde MGM mit NMR-spektroskopischen Mitteln untersucht. Bei der Analyse wurden NOE- und RDC (dipolare Restkopplungen)-restraints verwendet. Für die RDC-Analyse wurden anisotrope Proben in einem chemisch quervernetzten PDMS-Gel in CDCl3 angesetzt. In einer anschließenden simulated-annealing Berechnung mit XPLOR-NIH konnten niederenergetische Strukturen mit den ermittelten restraints berechnet werden. In einem Verfeinerungsprozess konnten zwei Strukturmodelle ermittelt werden, welche alle experimentellen Daten erfüllen.
Mit den gleichen NMR-spektroskopischen Methoden wurde ein Fotoschalter (Dithienylcyclopenten-Derivat) und ein antibiotisches Cyclopentenonderivat (4,6-Diacetylhygrophorone A12) untersucht. |
| Alternative Abstract: |
| Alternative Abstract | Language |
|---|
To get a deeper insight into the structure-activity relationship we used nuclear-Overhauser-effect- (NOE) and residual-dipolar-couplings- (RDC) restraints to determine the conformation of the MGM macrocycle in CDCl3. For the RDC-analysis we prepared anisotropic NMR-samples in a chemically cross-linked PDMS-gel. In a subsequent simulated-annealing calculation with XPLOR-NIH we used both NOE- and RDC-data as restraints. We could identify a structural bundle of low-energy structures which were in good agreement with NOE- and backbone RDC-restraints. After a structure refinement process by additionally using the proline side-chain RDCs we could identify two out of the 20 low-energy structures which are in good agreement with all experimental data.
Same kind of NMR-measurement techniques were used to investigates a photoswitchable Dithienylcyclopentene derivative and the antibiotic cyclopentenone 4,6-Diacetylhygrophorone A12. | English |
|
| Uncontrolled Keywords: |
Griselimycin, Methylgriselimycin, Tuberkulose, Diarylethene, Dithienylcyclopentene, Fotoschalter, Hygrophorone, antibiotisch, NMR-Spektroskopie, dipolare Restkopplungen, RDC, Alignment Medien, XPLOR-NIH, Maestro Schrödinger |
| Alternative keywords: |
| Alternative keywords | Language |
|---|
| Griselimycin, Methylgriselimycin, tuberculosis, Diarylethene, Dithienylcyclopentenes, photoswitches, Hygrophorone, antibiotic, NMR-Spektroscopy, residual dipolar couplings, RDC, alignment media, XPLOR-NIH, Maestro Schrödinger | English |
|
| URN: |
urn:nbn:de:tuda-tuprints-54540 |
| Classification DDC: |
500 Science and mathematics > 540 Chemistry |
| Divisions: |
07 Department of Chemistry > Clemens-Schöpf-Institut > Organ Chemistry |
| Date Deposited: |
12 May 2016 14:02 |
| Last Modified: |
09 Jul 2020 01:17 |
| URI: |
https://tuprints.ulb.tu-darmstadt.de/id/eprint/5454 |
| PPN: |
386821372 |
| Export: |
|
Drucken
Impressum