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Impaired Nrf1-dependent gene expression in cells replicating HCV results in elevated cholesterol levels and impacts the size of lipid droplets

Schorsch, Patrycja (2024)
Impaired Nrf1-dependent gene expression in cells replicating HCV results in elevated cholesterol levels and impacts the size of lipid droplets.
Technische Universität Darmstadt
doi: 10.26083/tuprints-00027802
Ph.D. Thesis, Primary publication, Publisher's Version

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Item Type: Ph.D. Thesis
Type of entry: Primary publication
Title: Impaired Nrf1-dependent gene expression in cells replicating HCV results in elevated cholesterol levels and impacts the size of lipid droplets
Language: English
Referees: Süß, Prof. Dr. Beatrix ; Hildt, Prof. Dr. Eberhard
Date: 31 July 2024
Place of Publication: Darmstadt
Collation: 107 Seiten
Date of oral examination: 21 March 2024
DOI: 10.26083/tuprints-00027802
Abstract:

Hepatitis C virus (HCV) infection may lead to chronic hepatitis. Currently, there are more than 57,8 million individuals globally who experience persistent infection, enduring the consequences of chronic hepatitis, which can often progress to liver fibrosis, cirrhosis and hepatocellular carcinoma (HCC). One mechanism to protect against oxidative stress is the Nrf2/Keap1 pathway. Nrf2/ARE signalling is impaired in HCV replicating cells, due to withdrawal of sMaf proteins from nucleus and binding to NS3 on the cytoplasmic site of the ER, as the integral part of replicon complex. The NS3-bound sMaf proteins bind to Nrf2, which prevents Nrf2 from entering the nucleus to trigger the expression of the genes responsible for protection against oxidative stress. Another factor involved in redox homeostasis is the ubiquitously expressed transcription factor Nrf1 of the Cap´N´Collar family. Nrf1 is located in the ER and upon stimulus, the inactive 120 kDa glycoprotein is selectively processed in the ER to gain distinct multiple isoforms (between ~25-kDa and ~140-kDa). Besides, Nrf1 has been recently described as a cholesterol sensor that protects the liver from excess cholesterol. In this thesis, the impact of HCV infection on Nrf1 expression, localization, antioxidant response and cholesterol sensing ability were studied. Additionally, the relevance of the Nrf1-HCV crosstalk for the viral life cycle and virus-associated pathogenesis was examined. The data indicated that, HCV infection reduced Nrf1 protein levels while increasing Nrf1 transcript expression in both cell culture models and liver sections of patients with chronic HCV infection. However, the HCV-induced decrease in Nrf1 protein levels was not attributed to a shortened half-life. Nrf1 knockdown experiments showed an impact on HCV protein levels and viral titers. Overexpression of Nrf1 fragments, specifically the 25kDa (dominant-negative inhibitor of longer NRF1 isoforms and NRF2) and 85kDa (cleaved and transcriptionally active isoform of Nrf1) isoforms, led to negative effects on the HCV life cycle, including replication, accumulation and release of viral particles. Additionally, the interplay between Nrf1 fragments and sMaf proteins influenced Nrf1 fragments localization. Overexpressing Nrf1 fragments could not rescue the decreased expression of the cytoprotective gene NQO1, suggesting the complexity of Nrf1's regulation in HCV infection. HCV infection impacts Nrf1 expression, localization and activity, disrupting host-virus interactions essential for efficient replication. The observed decrease in viral replication and impaired release of viral particles suggest Nrf1's potential regulatory role in modulating HCV infection. Additionally, the crosstalk between HCV and Nrf1 has a direct impact on the activation of Nrf1-ARE dependent gene expression including genes related to controlling of the lipid metabolism. HCV infection affects LXR promoter activity and Nrf1 fragments' overexpression has an impact on cholesterol regulation. The reduced activation of the LXR expression in HCV positive cells due to an impaired Nrf1-dependent activation of the LXR-promoter may be reflected by an impaired cholesterol export leading to an elevated intracellular cholesterol level. Inhibited activity of Nrf1 in HCV-positive cells influences the lipid content and therefore the number and size of lipid droplets. Targeting Nrf1 or its associated pathways may offer promising therapeutic strategies to disrupt the HCV life cycle and inhibit viral replication. The use of cell culture models is one of the study's limitations, which emphasizes the necessity of validation in in vivo systems or clinical samples. Taken together, these data provide the relevance of Nrf1's role as an antiviral factor in response to HCV infection in addition to a well-known crucial role in oxidative stress and cholesterol removal program. This study described for the first-time extensive work on the various mechanisms and explores the fragments of Nrf1 specific fragments in affecting HCV replication and host cells. Further studies in addressing the question about the about the Nrf1-HCV crosstalk, could be of interest to gain a better understanding of how Nrf1 modulates the oxidative stress response and cholesterol removal program in the context of viral infections.

Alternative Abstract:
Alternative AbstractLanguage

Die Infektion mit dem Hepatitis-C-Virus (HCV) führt zu chronischer Hepatitis. Derzeit sind weltweit mehr als 57,8 Millionen Menschen von einer persistierenden Infektion betroffen und leiden unter den Folgen einer chronischen Hepatitis, die häufig zu Leberfibrose, Zirrhose und Leberzellkarzinom (HCC) führen kann. Ein Mechanismus zum Schutz vor oxidativem Stress ist der Nrf2/Keap1-Signalweg. Der Nrf2/ARE-Signalweg ist in sich replizierenden HCV-Zellen beeinträchtigt, was darauf zurückzuführen ist, dass sich sMaf-Proteine aus dem Zellkern zurückziehen und an NS3 auf der zytoplasmatischen Seite des ER binden, das integraler Bestandteil des Replikonkomplexes ist. Die an NS3 gebundenen sMaf- Proteine binden an Nrf2, was Nrf2 daran hindert, in den Zellkern zu gelangen, um die Expression von Genen auszulösen, die für den Schutz vor oxidativem Stress verantwortlich sind. Ein weiterer an der Redox-Homöostase beteiligter Faktor ist der ubiquitär exprimierte Transkriptionsfaktor Nrf1 der Cap'N'Collar-Familie. Nrf1 ist im ER lokalisiert, und auf einen Stimulus hin wird das inaktive 120-kDa- Glykoprotein im ER selektiv prozessiert, um verschiedene multiple Isoformen (zwischen ~25-kDa und~140-kDa) zu bilden. Außerdem wurde Nrf1 kürzlich als Cholesterinsensor beschrieben, der die Leber vor überschüssigem Cholesterin schützt. In dieser Arbeit wurden die Auswirkungen einer HCV-Infektion auf die Nrf1-Expression, die Lokalisierung, die antioxidative Reaktion und die Fähigkeit, Cholesterin zu erkennen, untersucht. Außerdem wurde die Bedeutung des Nrf1-HCV-Crosstalk für den viralen Lebenszyklus und die virusassoziierte Pathogenese untersucht. Die Daten zeigten, dass die HCV-Infektion die Nrf1-Proteinspiegel reduzierte, während die Nrf1-Transkript-Expression sowohl in Zellkulturmodellen als auch in Leberschnitten von Patienten mit chronischer HCV-Infektion anstieg. Der HCV-induzierte Rückgang des Nrf1-Proteinspiegels wurde jedoch nicht auf eine verkürzte Halbwertszeit zurückgeführt. Nrf1-Knockdown-Experimente zeigten eine Auswirkung auf HCV-Proteinspiegel und Virustiter. Die Überexpression von Nrf1-Fragmenten, insbesondere der 25kDa- (dominant-negativer Inhibitor längerer NRF1-Isoformen und NRF2) und 85kDa-Isoformen (gespaltene und transkriptionell aktive Isoform von Nrf1), führte zu negativen Auswirkungen auf den HCV-Lebenszyklus, einschließlich Replikation, Akkumulation und Freisetzung viraler Partikel. Außerdem beeinflusste das Zusammenspiel zwischen Nrf1-Fragmenten und sMaf-Proteinen die Lokalisierung der Nrf1-Fragmente. Die Überexpression von Nrf1-Fragmenten konnte die verminderte Expression des zytoprotektiven Gens NQO1 nicht retten, was auf die Komplexität der Nrf1-Regulierung bei HCV-Infektionen hindeutet. Eine HCV-Infektion beeinflusst die Nrf1-Expression, -Lokalisierung und -Aktivität und stört die für eine effiziente Replikation wichtigen Wirt-Virus-Interaktionen. Der beobachtete Rückgang der viralen Replikation und die beeinträchtigte Freisetzung von Viruspartikeln deuten auf eine mögliche regulatorische Rolle von Nrf1 bei der Modulation der HCV-Infektion hin. Darüber hinaus hat die Wechselwirkung zwischen HCV und Nrf1 einen direkten Einfluss auf die Aktivierung der Nrf1-ARE- abhängigen Genexpression, einschließlich der Gene, die mit der Kontrolle des Fettstoffwechsels zusammenhängen. Die HCV-Infektion beeinträchtigt die Aktivität des LXR-Promotors, und die Überexpression von Nrf1-Fragmenten wirkt sich auf die Cholesterinregulation aus. Die verminderte Aktivierung der LXR-Expression in HCV-positiven Zellen aufgrund einer gestörten Nrf1-abhängigen Aktivierung des LXR-Promotors kann sich in einem gestörten Cholesterinexport niederschlagen, der zu einem erhöhten intrazellulären Cholesterinspiegel führt. Die gehemmte Aktivität von Nrf1 in HCV-positiven Zellen beeinflusst den Lipidgehalt und damit die Anzahl und Größe der Lipidtröpfchen. Die gezielte Beeinflussung von Nrf1 oder der damit verbundenen Signalwege könnte vielversprechende therapeutische Strategien zur Unterbrechung des HCV-Lebenszyklus und zur Hemmung der viralen Replikation bieten. Die Einschränkungen der Studie, wie die Verwendung von Zellkulturmodellen, unterstreichen jedoch die Notwendigkeit einer Validierung in In-vivo-Systemen oder klinischen Proben. Zusammenfassend lässt sich sagen, dass diese Studie wertvolle Einblicke in die potenzielle Rolle von Nrf1 als antiviraler Faktor bei der Reaktion auf HCV-Infektionen liefert. Die Interaktion zwischen Nrf1 und HCV wirkt sich auf die virale Replikation und Freisetzung aus, was das therapeutische Potenzial von Nrf1 bei der Bekämpfung von Virusinfektionen unterstreicht. Zukünftige Forschungen werden entscheidend sein, um die genauen Mechanismen aufzudecken, durch die Nrf1 seine antiviralen Wirkungen entfaltet, und so den Weg für innovative Interventionen zur Verbesserung der Abwehrmechanismen des Wirts gegen virale Krankheitserreger zu öffnen.

German
Status: Publisher's Version
URN: urn:nbn:de:tuda-tuprints-278024
Classification DDC: 500 Science and mathematics > 570 Life sciences, biology
Divisions: 10 Department of Biology > Synthetic RNA biology
Date Deposited: 31 Jul 2024 12:19
Last Modified: 01 Aug 2024 07:33
URI: https://tuprints.ulb.tu-darmstadt.de/id/eprint/27802
PPN: 520245008
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