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Menachinone sind aufgrund ihrer hydrophoben Eigenschaften membranständige Moleküle und kommen in sehr vielen Mikroorganismen vor. Sie lassen sich mittels zwei Elektronen zur jeweiligen Menachinol-Form reduzieren. In der Membran von Bakterien und Archaeen bilden Chinone einen Chinonpool und fungieren als universelle Redoxmediatoren. Mikroorganismen aus anaeroben Habitaten besitzen im Chinonpool oft neben dem klassischen Menachinon (MK) methylierte MK-Derivate wie Methylmenachinon (MMK) und Dimethylmenachinon (DMMK). Da die methylierten Menachinone bei negativeren Standardredoxpotenzialen als MK operieren, spielen sie eine entscheidende Rolle für spezifische Elektronentransportketten der anaeroben Atmung.