Chelicerata gehören zu den ältesten Arthropoden und sind in kambrischen Fossilstätten häufig vertreten. Milben (Acari) sind die artenreichste Gruppe innerhalb der phylogenetisch alten Linie der Chelicerata. Hornmilben (Acari, Oribatida) sind artenreich und kommen ubiquitär in Bodensystemen vor, wo sie eine wichtige Gruppe im Zersetzersystem bilden. Hornmilben entwickelten sich vermutlich an Land und sind ein phylogenetisch sehr altes Taxon, da die ältesten Fossilien aus dem frühen Devon stammen (vor ~380 Millionen Jahren). Auffällig bei Hornmilben ist, dass Parthenogenese weit verbreitet ist und parthenogenetische Linien sogar radiierten. Die dauerhafte Existenz von Linien, die sich ohne Männchen reproduzieren, widerspricht den weitläufig bekannten Theorien über die Funktion und Aufrechterhaltung von Sex und ist sehr selten im Tierreich. Weniger als 1% aller bekannten Organismen pflanzen sich ohne Sex fort, bei Hornmilben sind 10% aller Linien parthenogenetisch. In dieser Arbeit wurden Hornmilben mit molekularen Markern unterschiedlicher Auflösung auf evolutionäre Prozesse in drei Zeitebenen untersucht. Das Alter der Hornmilben wurde auf Grundlage von 18S rDNA Sequenzen und einer entspannten Molekularen Uhr, basierend auf baysianischem Algorithmus, berechnet. Die Radiation der basalen Hornmilbentaxa fand in einem Zeitfenster zwischen der Kambrischen Explosion (vor 540 Millionen Jahren) und der Entstehung der ersten terrestrischen Ökosysteme, die von Fossilien bekannt sind (vor 410 Millionen Jahren), statt. Hornmilben waren daher wahrscheinlich unter den ersten Landbesiedlern und nutzten das marine Sandlückensystem als ‚Sprungbrett’ für die Besiedlung terrestrischer Lebensräume. Die Ergebnisse legen nahe, dass die frühen terrestrischen Nahrungsnetze von omnivoren und detritivoren Arthropoden gebildet wurden, die den Weg für folgende Landgänger höherer trophischer Ebenen bereiteten. Die Rekonstruktion der ursprünglichen Reproduktionmodi zeigt, dass die Besiedlung echter Böden an Land durch Hornmilben zum mehrfachen Verlust der sexuellen Reproduktionsweise in den basalen Linien führte und dass einige Linien sich seit mehreren Millionen Jahren parthenogenetisch fortpflanzen. Die letzte Eiszeit vor ~115.000-11.000 Jahren hat den Artenreichtum und die genetische Vielfalt in Europa maßgeblich beeinflusst. Unter Verwendung molekularer Marker, die eine mittlere zeitliche Auflösung von mehreren Millionen Jahren, im Vergleich zu den mehreren hundert Millionen Jahren, die durch 18S erfasst werden, wurde die Auswirkung dieser gewaltigen klimatischen „Störung“ auf Bodenorganismen untersucht. Die Veränderungen im mitochondrialen Gen Cytochromoxidase I (COI) wurden auf europaweiter Ebene in zwei Hornmilben- und zwei Collembolenarten (Hexapoda, Collembola) untersucht. Die Besiedlungsmuster und Refugien unterscheiden sich bei Hornmilben und Collembolen, aber in allen vier Arten war die genetische Diversität sehr hoch, sowohl im kleinen als auch im großen räumlichen Maßstab, und die genetische Distanz innerhalb der Arten war außerordentlich groß (>18% unkorrigierte p-Distanz). Die Ergebnisse zeigen, dass die gegenwärtigen genetischen Strukturen von Bodenorganismen präglazialen Ursprungs sind und auf Diversifizierungsereignisse vor dem Pleistozän zurückgehen. Dies weist darauf hin, dass die maßgeblichen evolutionären Kräfte, die das unterirdische System beeinflussen, von denen die oberirdische Systeme prägen, abweichen. Die Prozesse, welche zur Artbildung im Boden führen, sind noch unbekannt und das weitverbreitete Auftreten von Parthenogenese bei Bodentieren wurde bisher wenig beachtet. Mikrosatelliten sind molekulare Marker, die gegenwärtige genetische Populationsstrukturen auflösen und so die aktuellste evolutionäre Geschichte von Arten beschreiben können. Sie eignen sich auch zur Identifikation von Reproduktionsstrategien. Mit Hilfe von Mikrosatelliten wurde die Populationsstruktur und genetische Diversität einer sexuellen und einer parthenogenetischen Hornmilbe untersucht, die in einem Habitat koexistieren. Die Ergebnisse zeigen, dass auch bei diesen Markern und auf kleinem Raum die genetische Diversität in beiden Arten hoch ist. Genfluß in der sexuellen Art jedoch verbindet alle Individuen des Probegebietes zu einer einzigen genetischen Population. Die asexuelle Reproduktionsstrategie der parthenogenetischen Art konnte bestätigt werden und die Population war stärker strukturiert, was auf geringere Mobilität dieser Art im Boden schließen lässt. Umweltfaktoren, welche die aggregierte Verteilung von Individuen beider Arten steuern, konnten nicht identifiziert werden. Dennoch zeigte sich, dass Mikrosatelliten vielversprechend sind, um die genetische Beschaffenheit von Hornmilbenpopulationen zu beschreiben und bisher unbekannte Größen wie Populationsstruktur, Populationsgröße und Genfluß zu untersuchen.