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  5. NMR-Based Configurational Assignments of Natural Products: Gibbs Sampling and Bayesian Inference Using Floating Chirality Distance Geometry Calculations
 
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2022
Zweitveröffentlichung
Artikel
Verlagsversion

NMR-Based Configurational Assignments of Natural Products: Gibbs Sampling and Bayesian Inference Using Floating Chirality Distance Geometry Calculations

File(s)
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Hauptpublikation
marinedrugs-20-00014-v2.pdf
CC BY 4.0 International
Format: Adobe PDF
Size: 4.61 MB
TUDa URI
tuda/7899
URN
urn:nbn:de:tuda-tuprints-202834
DOI
10.26083/tuprints-00020283
Autor:innen
Immel, Stefan ORCID 0000-0002-6524-2399
Köck, Matthias ORCID 0000-0003-0211-6341
Reggelin, Michael ORCID 0000-0003-3650-3921
Kurzbeschreibung (Abstract)

Floating chirality restrained distance geometry (fc-rDG) calculations are used to directly evolve structures from NMR data such as NOE-derived intramolecular distances or anisotropic residual dipolar couplings (RDCs). In contrast to evaluating pre-calculated structures against NMR restraints, multiple configurations (diastereomers) and conformations are generated automatically within the experimental limits. In this report, we show that the "unphysical" rDG pseudo energies defined from NMR violations bear statistical significance, which allows assigning probabilities to configurational assignments made that are fully compatible with the method of Bayesian inference. These "diastereomeric differentiabilities" then even become almost independent of the actual values of the force constants used to model the restraints originating from NOE or RDC data.

Freie Schlagworte

distance geometry cal...

configurational analy...

chirality

NMR spectroscopy

residual dipolar coup...

assignment probabilit...

statistical error ana...

Sprache
Englisch
Fachbereich/-gebiet
07 Fachbereich Chemie > Clemens-Schöpf-Institut > Fachgebiet Organische Chemie
DDC
500 Naturwissenschaften und Mathematik > 540 Chemie
500 Naturwissenschaften und Mathematik > 570 Biowissenschaften, Biologie
Institution
Universitäts- und Landesbibliothek Darmstadt
Ort
Darmstadt
Titel der Zeitschrift / Schriftenreihe
Marine Drugs
Jahrgang der Zeitschrift
20
Heftnummer der Zeitschrift
1
ISSN
1660-3397
Verlag
MDPI
Publikationsjahr der Erstveröffentlichung
2022
Verlags-DOI
10.3390/md20010014
PPN
500731373

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