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  5. Reliable dynamics in Boolean and continuous networks
 
  • Details
2012
Zweitveröffentlichung
Artikel
Verlagsversion

Reliable dynamics in Boolean and continuous networks

File(s)
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Hauptpublikation
njp12_12_123029.pdf
CC BY-NC-SA 3.0 Unported
Format: Adobe PDF
Size: 758.84 KB
TUDa URI
tuda/8095
URN
urn:nbn:de:tuda-tuprints-205666
DOI
10.26083/tuprints-00020566
Autor:innen
Ackermann, Eva
Peixoto, Tiago P.
Drossel, Barbara ORCID 0000-0001-7115-6182
Kurzbeschreibung (Abstract)

We investigate the dynamical behavior of a model of robust gene regulatory networks which possess ‘entirely reliable’ trajectories. In a Boolean representation, these trajectories are characterized by being insensitive to the order in which the nodes are updated, i.e. they always go through the same sequence of states. The Boolean model for gene activity is compared with a continuous description in terms of differential equations for the concentrations of mRNA and proteins. We found that entirely reliable Boolean trajectories can be reproduced perfectly in the continuous model when realistic Hill coefficients are used. We investigate to what extent this high correspondence between Boolean and continuous trajectories depends on the extent of reliability of the Boolean trajectories, and we identify simple criteria that enable the faithful reproduction of the Boolean dynamics in the continuous description.

Sprache
Englisch
Fachbereich/-gebiet
05 Fachbereich Physik > Institut für Physik Kondensierter Materie (IPKM)
DDC
500 Naturwissenschaften und Mathematik > 530 Physik
Institution
Universitäts- und Landesbibliothek Darmstadt
Ort
Darmstadt
Titel der Zeitschrift / Schriftenreihe
New Journal of Physics
Jahrgang der Zeitschrift
14
Heftnummer der Zeitschrift
12
ISSN
1367-2630
Verlag
IOP Publishing
Ort der Erstveröffentlichung
London
Publikationsjahr der Erstveröffentlichung
2012
Verlags-DOI
10.1088/1367-2630/14/12/123029
PPN
513704183

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