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Untersuchung der Translationsdynamik von Wasser in Proteinmatrizen mit Hilfe von Feldgradienten-NMR

Rosenstihl, Markus :
Untersuchung der Translationsdynamik von Wasser in Proteinmatrizen mit Hilfe von Feldgradienten-NMR.
TU Darmstadt, Darmstadt
[Ph.D. Thesis], (2012)

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Item Type: Ph.D. Thesis
Title: Untersuchung der Translationsdynamik von Wasser in Proteinmatrizen mit Hilfe von Feldgradienten-NMR
Language: German
Abstract:

In der hier vorgestellten Arbeit zur Translationsdiffusion von Wasser in Proteinmatrizen wurde gezeigt, dass bei der Bestimmung des Diffusionskoeffizienten mit Hilfe von Stimulierter-Echo-Feldgradienten-NMR der Effekt der Kreuzrelaxation – der Austausch von Magnetisierung zwischen Wasser- und Proteinprotonen – einen nicht vernachlässigbaren Effekt darstellt. Das Modell von Peschier, welches den Einfluss von Kreuzrelaxation und Diffusion auf den zeitlichen Verlauf der Magnetisierung beschreibt, wurde zunächst numerisch untersucht. Insbesondere wurden verschiedene typische Feldgradienten-Experimente zur Bestimmung von Diffusionskoeffizienten simuliert, um den Einfluss von Kreuzrelaxation auf die Auswertung zu zeigen. Die Ergebnisse belegen, dass einige Veröffentlichungen von Diffusionsmessungen mittels NMR entweder den Effekt der Kreuzrelaxation nicht beachten, oder aber die Messungen an der Grenze des Arbeitsbereichs der Methode der gepulsten Feldgradienten-NMR (PFG-NMR) durchgeführt wurden. Im Rahmen der vorliegenden Arbeit wurde ein Protokoll entwickelt, um Stimulierte-Echo-(STE)-NMR-Messungen in starken statischen Feldgradienten (SFG) mit g ≥ 180 T/m auswerten zu können. Das Ziel der durchgeführten Messungen war, Aussagen über einen postulierten Fragil-Stark-Übergang des Hydratationswassers treffen zu können, und die Verwendung von SFG-STE-Experimenten als Methode zur Untersuchung der Translationsdynamik von Wassermolekülen in der Hydratationsschicht von Proteinen zu etablieren.

Alternative Abstract:
Alternative AbstractLanguage
In this work the translational dynamics of hydration water in protein matrices is investigated. It was shown that the determination of diffusion coefficents of water in protein matrices with field gradient NMR is non-trivially influenced by the effect of cross relaxation, the exchange of magnetization between water and protein protons. The model of Peschier, which describes how cross relaxation and diffusion affect the temporal evolution of the proton magnetization, was numerically solved. In order to elucidate the influence of cross relaxtion on diffusion measurements, typical NMR field gradient experiments have been simulated. A protocol has then been developed in order to analyse and elicit diffusion coefficents in a reliable way out of data from stimulated echo (STE) NMR experiments in high ( g ≥ 180 T/m) static field gradients (SFG). The findings show that either the effect of cross relaxation has been neclected in previous diffusion studies of hydration water or that the diffusion measurements have been conducted at the limit of the working regime of the used method, the pulsed field gradient (PFG) NMR. One goal of the present study was to test for the existence of the putative fragile-to-strong transition (FST) of supercooled hydration water at Tx = 223 K, and to establish the SFG-STE method for the study of translational dynamics of water in protein matrices. The present work devises explicitly the limit of the determination of diffusion coefficients of water in protein matrices. Evidence is given that it is not possible, using the samples and methods studied in this work, to study the translational dynamics in the vanity of the temperature where a change of temperature dependence of D is found ( Tx = 223 K).English
Series Name: Markus Rosenstihl
Place of Publication: Darmstadt
Classification DDC: 500 Naturwissenschaften und Mathematik > 530 Physik
Divisions: Fachbereich Physik
Date Deposited: 30 Oct 2012 17:24
Last Modified: 07 Dec 2012 12:05
URN: urn:nbn:de:tuda-tuprints-31318
License: Creative Commons: Attribution-Noncommercial-No Derivative Works 3.0
Referees: Vogel, Prof. Dr. Michael and Fujara, Prof. Dr. Franz
Refereed: 25 April 2012
URI: http://tuprints.ulb.tu-darmstadt.de/id/eprint/3131
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